古代
理县女皇峰
理县新石器时代杂谷脑河畔就有人类生息繁衍。《禹贡》为梁州之域，秦属湔氐道。
西汉元鼎六年（公元前111年）置
汶山郡，始入中央版图。西汉地节三年（公元前67年）设
广柔县，属蜀郡。
东汉灵帝光和七年（178年）属汉山郡。
隋开皇六年（587年）置
金川县（治所今通化乡卡子村）。
仁寿元年（601年）改为
通化县。唐武德八年（625年）置
维州和薛城县，后陆续设小封县、维州和定廉县。
宋、元设为
霸州和保宁县。明永乐五年（1407年）置杂谷
安抚司。
清
乾隆十七年（1752年），剿灭杂谷土司苍旺，
改土归流置理番直隶厅，取治理番民之意。
清乾隆十七年（1752年）改土归流，废杂谷土司，设杂谷厅（治所今薛城）。
乾隆二十五年（1760年）升为直隶厅，嘉庆八年(1803年）改为理番直隶厅，辖域辽阔，有“四土、五屯、九枯、十家、三番、六里”之称。
近现代
薛城筹边楼
民国初期改厅州为县，民国2年（1913年）改为理番县，属川西道。民国24年属四川省第十六行政督察区。民国35年（1946年）为缓和民族矛盾去“番”，改理番县名为理县。
1950年1月16日成立理县人民政府，属茂县专区。1951年11月县治由薛城迁杂谷脑。1958年7月析县成立含汶川、茂县在内的茂汶羌族
自治县，1963年6月分县恢复理县至今。
1990年全县行政建置为2镇、12乡、82村。4个居委会、203个村民小组。
1997年，理县面积4313.4平方千米，人口4.3万。辖3镇10乡。县政府驻杂谷脑镇。
2000年，理县辖4个镇、9个乡。
2020年，全县辖杂谷脑、米亚罗、古尔沟、朴头、薛城、桃坪6个镇；甘堡、蒲溪、上孟、下孟、通化5个乡。按照省委省政府、州委州政府关于村级建制改革的相关部署要求，理县的村级建制调整改革工作于2020年2月启动，6月份完成。调整改革完成后，设置村(居)民委员会71个，其中:村民委员会63个、居民委员会8个。
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